Osteoartikuläre Beteiligung-assoziierte Biomarker und Pathways in Psoriasis: The Shared Pathway with Spondylitis ankylosans

Psoriasis-Arthritis (PsA) ist eine einzigartige immunvermittelte Erkrankung mit kutaner und osteoartikulärer Beteiligung. Allerdings haben nur wenige Studien die Anfälligkeit einer osteoartikulären Beteiligung bei Psoriasis (Ps) auf genetischer Ebene untersucht. Diese Studie untersuchte die mit osteoartikulärer Beteiligung assoziierten Biomarker und mögliche gemeinsame molekulare Mechanismen für PsA und ankylosierende Spondylitis (AS).

Methoden:

Die RNA-seq-Daten von Ps, PsA und AS in der Gene Expression Omnibus (GEO)-Datenbank wurden erhalten. Zuerst haben wir das Limma-Paket und die gewichtete Gen-Co-Expression-Netzwerkanalyse (WGCNA) verwendet, um die potenziellen Gene im Zusammenhang mit PsA und AS zu identifizieren. Dann wurden die gemeinsamen Gene in PsA und AS unter Verwendung der GO-, KEGG- und GSEA-Analysen durchgeführt. Wir haben auch maschinelles Lernen verwendet, um Hub-Gene zu screenen. Die Ergebnisse wurden anhand externer Datensätze und nativer Kohorten validiert. Schließlich haben wir den CIBERSORT-Algorithmus verwendet, um die Korrelation zwischen Hub-Genen und der Häufigkeit von Immunzellen in Geweben abzuschätzen.

Ergebnisse:

Eine Überlappung wurde zwischen den PsA- und AS-bezogenen Modulen als 9 Gene beobachtet. Für differentiell exprimierte Gene in AS und PsA wurde nur ein überlappendes Gen gefunden (COX7B). Genanreicherungsanalysen zeigten, dass die oben genannten 9 Gene mit dem mRNA-Überwachungsweg zusammenhängen könnten. Die GSEA-Analysen zeigten, dass COX7B an der adaptiven Immunantwort, Zellaktivierung usw. beteiligt war. PUM1 und ZFP91, die von der Support Vector Machine identifiziert wurden, hatten bevorzugte Werte als diagnostische Marker für osteoartikuläre Beteiligung bei Ps und AS (AUC > 0,7). Schließlich zeigten die CIBERSORT-Ergebnisse eine Beteiligung von PUM1 und ZFP91 an Veränderungen der Mikroumgebung des Immunsystems.

Fazit:

Zum ersten Mal zeigte diese Studie, dass die osteoartikuläre Beteiligung an Psoriasis und AS durch den mRNA-Überwachungsweg vermittelten abnormalen immunologischen Prozess vermittelt werden könnte. Die biologischen Prozesse können das Übersprechen zwischen PsA und AS darstellen. Daher könnten PUM1 und ZFP91 als potenzielle Biomarker oder therapeutische Ziele für AS- und Ps-Patienten verwendet werden.

Schlüsselwörter:

WGCNA; Spondylitis ankylosans; differenzielle Genanalyse; Schuppenflechte; Psoriasis-Arthritis.

Dies ist ein automatisch übersetzter Artikel. Er kann nur einer groben Orientierung dienen. Das Original gibt es hier: psoriasis

Schreibe einen Kommentar